标签: scRNA-seq
包含该标签的所有文章 "scRNA-seq".
-
复现 Campbell et al. 下丘脑 Arc-ME 单细胞图谱:从 GSE93374 到神经内分泌细胞注释边界
基于 Campbell et al. GSE93374 公开 Arc-ME Drop-seq DGE 矩阵和细胞 metadata,复现下丘脑弓状核/正中隆起细胞图谱、神经肽 marker、tanycyte/胶质/血管注释证据和解释边界。
-
复现 Montoro et al. 气道 ionocyte 单细胞数据:从 GSE103354 到 CFTR/Foxi1 稀有上皮群体注释证据
基于 Montoro et al. GSE103354 公开 droplet UMI 和 full-length TPM 矩阵,复现气道上皮 CFTR/Foxi1 ionocyte 稀有细胞注释、marker 组合和解释边界。
-
复现 Nestorowa et al. HSPC 分化单细胞图谱:从 GSE81682 到谱系相关表达梯度
基于 Nestorowa et al. GSE81682 公开 HTSeq counts 矩阵,复现小鼠 HSPC 分化图谱中的 FACS 富集、lineage marker、signature 倾向和非离散性分化边界。
-
复现 Shalek et al. 树突状细胞 LPS 响应数据:从 GSE48968 到炎症/IFN 程序和细胞间异质性
基于 Shalek et al. GSE48968 公开 allgenes TPM 矩阵,复现树突状细胞 LPS 时间响应中的炎症/NFkB、IFN/ISG、响应状态和扰动组表达边界。
-
复现 Darmanis et al. GBM 迁移前沿单细胞数据:从 GSE84465 到肿瘤浸润边界和微环境信号
基于 Darmanis et al. GSE84465 公开 read-count 矩阵,复现 3,589 个 GBM 肿瘤及迁移前沿相关单细胞的 cell type、neoplastic status、tissue label、marker program 和复现边界。
-
复现 Gokce et al. 小鼠纹状体单细胞分类:从 GSE82187 到神经元、胶质和采样协议边界
基于 Gokce et al. GSE82187 公开 log10 CPM 矩阵,复现小鼠纹状体 Neuron、Astro、Oligo、OPC、Microglia、Vascular 等细胞类型结构,并解释 protocol、marker 和 taxonomy 层级边界。