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已发布的全部公开笔记。
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乳腺癌单细胞图谱复现:26 位患者、三种亚型能回答什么,不能回答什么
用GSE176078公开矩阵复核三个乳腺癌亚型的患者级组成差异:全局族边界下15个检验0项通过BH,且在观测效应量处无一达到0.8功效。
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结直肠癌单细胞数据复现:患者级组成变化与配对边界
基于配对肿瘤—正常样本,在患者级复核结直肠癌单细胞组成、状态与pseudobulk差异;先冻结可估计部分,再区分回收份额、组织组成与跨区室背景。
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肝硬化单细胞数据复现:分选纯度如何改变组成学结论?
用GSE136103公开矩阵重做供者级组成分析:CD45分选纯度与分组共变,同一份计数矩阵在两种自洽的参照集合下给出符号相反的结论。
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人胎儿细胞图谱复现:四百万细胞之后,证据该回到哪一个统计单位?
基于GSE156793 S3 raw exonic-count loom及作者汇总资源,完成四百万细胞全量计数闭合与胎儿级组织、日龄审计。
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胰腺癌单细胞与空间数据复现:spot 共表达能说明到哪一步
基于GSE111672 processed UMI counts,按患者、run和空间section复核PDAC单细胞标签与spot程序关联的证据边界。
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新冠 BALF 单细胞数据复现:6.6 万个细胞之后,证据仍来自 13 位供者
基于GSE145926及HC4公开10x矩阵,按供者复核新冠BALF严重度相关程序、伪bulk与标签敏感性。