关于
Single-cell reproduction
这里是一个面向公开单细胞 RNA-seq 数据多类型分析、图表复现和结果再解释的公开笔记站。内容会尽量保留数据来源、分析思路、关键图表、marker 证据和可延伸问题,把经典单细胞文献或公开数据库项目整理成可复查、可继续深挖的科研分析案例。
内容范围
公开数据复现GEO / SRA 等公共数据库中的单细胞 RNA-seq 项目复现和图表重做。
注释与 marker 解读h5ad / Seurat 对象整理、细胞注释、marker 面板复核和亚群命名检查。
亚群深度挖掘围绕细胞状态、发育连续性、响应评分、组成变化和关键亚群做进一步解释。
研究思路整理把 UMAP、marker、composition、signature 等结果整理成论文、汇报或课题设计可用的问题线索。
可以联系的场景
- 经典单细胞论文或文献中的公开数据复现
- GEO / SRA 等公共数据库单细胞项目的重新分析
- 私有单细胞课题数据的流程复现、结果整理和图表重做
- 旧单细胞项目的再次梳理、注释优化和补充图表
- 已有单细胞结果向文章、汇报或课题申请中可用图形的整理
- 已有图表看不出重点,需要重新组织 marker、细胞注释、亚群差异和后续研究方向
联系时可以直接说明这几件事
- 想复现或重分析的论文、GEO/SRA 编号、h5ad/Seurat 对象或已有图表。
- 当前最卡的问题:注释不稳、marker 看不清、亚群没挖透、发育/响应解释不连续,或旧项目需要重新整理成可用图。
- 希望得到的结果形式:复现长文、汇报图、文章图、注释表、marker 解释或后续分析思路。
邮箱:mfire@sina.cn
小红书 ID:1139779856
站点只发布可公开内容,不放置私有报告、客户数据或敏感样本信息。私有单细胞项目只会在授权范围内进行分析和交付。