标签: 肿瘤微环境

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• 复现 Darmanis et al. GBM 迁移前沿单细胞数据：从 GSE84465 到肿瘤浸润边界和微环境信号

  2026年7月4日

  基于 Darmanis et al. GSE84465 公开 read-count 矩阵，复现 3,589 个 GBM 肿瘤及迁移前沿相关单细胞的 cell type、neoplastic status、tissue label、marker program 和复现边界。

• Puram 头颈鳞癌深度复现：从 GSE103322 到 p-EMT、CAF 和免疫耗竭边界

  2026年6月29日

  基于 Puram et al. 头颈鳞癌公开 processed matrix，深度复核 5902 个细胞中的 malignant、CAF、T cell、髓系和内皮结构，并解释 p-EMT、T cell exhaustion、hypoxia signature 的复现边界。

• Chung 乳腺癌单细胞深度复现：从 GSE75688 到肿瘤、免疫和基质细胞图谱

  2026年6月28日

  基于 Chung et al. 乳腺癌单细胞 RNA-seq 公开 processed TPM 矩阵，复现 515 个单细胞中的肿瘤、T/B 细胞、髓系和基质结构，并说明公开矩阵层面的复现边界。

• Tirosh 黑色素瘤深度复现：从 GSE72056 到恶性细胞程序、T 细胞耗竭和肿瘤微环境组成

  2026年6月26日

  基于 Tirosh et al. 黑色素瘤单细胞数据 GSE72056，进一步从作者 revised processed matrix 和注释出发，复核恶性/非恶性标签、肿瘤间组成、MITF/AXL-like 程序、T cell exhaustion 和公开矩阵层面的复现边界。

• 复现 Puram et al. 头颈鳞癌单细胞图谱：从 GSE103322 到肿瘤微环境和 p-EMT 信号

  2026年6月8日

  基于 Puram et al. 2017 Cell 头颈鳞癌单细胞数据 GSE103322，复现 5902 个细胞的恶性细胞、成纤维细胞、T 细胞、内皮、B 细胞、巨噬细胞等主要图谱，并检查 p-EMT、T 细胞耗竭和缺氧相关信号。

• 复现 Tirosh et al. 黑色素瘤单细胞数据：从 GSE72056 到肿瘤微环境图谱

  2026年6月7日

  基于 Tirosh et al. 2016 Science 经典黑色素瘤单细胞数据 GSE72056，复现恶性细胞、T 细胞、B 细胞、巨噬细胞、CAF、内皮细胞和 NK 细胞组成，并对 MITF/AXL 状态与 T 细胞耗竭信号进行图谱化解读。