标签: 论文复现
包含该标签的所有文章 "论文复现".
-
远端肺上皮发育数据复现:从 GSE52583 到 AT1/AT2 与 progenitor 状态
从 GSE52583 的单细胞 FPKM tracking 文件出发,核对文件分母、连续肺上皮程序、胚胎级汇总与同矩阵分离 marker 一致性。
-
IFN-beta PBMC 深度复现:从 GSE96583 到 individual 级干扰素响应
在 Kang et al. GSE96583 PBMC IFN-beta 数据的基础上,对齐作者 batch2 metadata,过滤 singlet,补充 original individual、原文 cell type、CellTypist 注释对照和配对 IFN 响应汇总。
-
小鼠 ESC 分化单细胞数据复现:从 GSE65525 到多能性下降与早期分化状态
从 GSE65525 的 6 个 ESC 输入矩阵出发,将 d0 的技术重复嵌套到对应生物样本后汇总连续 pluripotency/differentiation program,并明确后续时间点缺少重复。
-
Seq-Well PBMC/MTB 单细胞数据复现:从 GSE92495 到髓系反应图谱
核对 GSE92495 第一方元数据后,重做 4638 个单核细胞来源巨噬细胞的 M. tuberculosis 暴露分析,分开呈现作者 cluster、连续 macrophage/IFN/抗原呈递程序和重复边界。
-
PBMC 68k 单细胞数据复现:从公开 10x 矩阵到大规模免疫参考图谱
从 10x Genomics 公开 fresh PBMC 68k filtered matrix 出发,复核 QC、Leiden 结构、连续免疫程序、同矩阵 marker 一致性和单 donor 数据的统计边界。
-
小鼠视觉皮层单细胞图谱复现:从 GSE71585 到兴奋性、抑制性和胶质细胞分类
基于 Tasic et al. 公开小鼠视觉皮层单细胞数据 GSE71585,复现 1,749 个作者 QC 通过细胞的 broad type、primary type、marker、signature score 和聚类对照,重点解释 glutamatergic、GABAergic、astrocyte、oligodendrocyte、OPC、microglia 和 endothelial 结构。