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• 复现 Macosko et al. 经典 Drop-seq 视网膜数据：从 GSE63472 到 P14 retina 细胞图谱

  2026年6月8日

  从 GSE63472 processed logDGE 中固定抽取 8000 个细胞，按 GEO 的 7 个实验样本和 4 个采集日整理连续视网膜 program，并撤掉最高分身份比例。

• 复现 MacParland et al. 人肝脏单细胞图谱：从 GSE115469 到肝细胞、LSEC 和 Kupffer 细胞结构

  2026年6月8日

  基于 MacParland et al. 2018 Nature Communications 人肝脏单细胞数据 GSE115469，复现 8444 个细胞的 hepatocyte、LSEC、portal endothelial、cholangiocyte、macrophage、T/NK/B/plasma 等图谱，并检查肝细胞、内皮和 Kupffer/髓系相关 marker。

• 复现 Haber et al. 小肠上皮单细胞图谱：从 GSE92332 到干细胞-分化谱系

  2026年6月8日

  基于 Haber et al. 2017 Nature 小肠上皮单细胞数据 GSE92332，复现 7216 个小鼠小肠上皮细胞的 Stem、TA、Enterocyte、Goblet、Paneth、Tuft 和 Endocrine 谱系图谱，并用 marker 与 signature 检查细胞身份。

• 复现 Puram et al. 头颈鳞癌单细胞图谱：从 GSE103322 到肿瘤微环境和 p-EMT 信号

  2026年6月8日

  基于 Puram et al. 2017 Cell 头颈鳞癌单细胞数据 GSE103322，复现 5902 个细胞的恶性细胞、成纤维细胞、T 细胞、内皮、B 细胞、巨噬细胞等主要图谱，并检查 p-EMT、T 细胞耗竭和缺氧相关信号。

• 复现 Zeisel et al. 小鼠脑数据：broad compartment 与 taxonomy 边界

  2026年6月7日

  基于 Zeisel et al. 2015 年 GSE60361 主矩阵，复核 3,005 个细胞的无监督结构、连续脑区室程序、同矩阵 marker 一致性和无 donor/batch 时的解释边界。

• 复现Tabula Muris小鼠脾脏子集：连续免疫程序与小鼠级边界

  2026年6月7日

  基于Tabula Muris GSE109774脾脏SmartSeq2/FACS子集，拼接1,718个单细胞CSV，区分9个cluster、1,704个mapped cells和6只小鼠，并以连续免疫程序取代硬标签组成。