标签: scRNA-seq

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• 复现 Klein et al. inDrops ESC 分化数据：从 GSE65525 到多能性下降和早期分化状态

  2026年6月16日

  从 GSE65525 的 6 个 ESC 输入矩阵出发，将 d0 的技术重复嵌套到对应生物样本后汇总连续 pluripotency/differentiation program，并明确后续时间点缺少重复。

• 复现 Gierahn Seq-Well：Mtb 暴露巨噬细胞能读出哪些状态？

  2026年6月15日

  核对 GSE92495 第一方元数据后，重做 4638 个单核细胞来源巨噬细胞的 M. tuberculosis 暴露分析，分开呈现作者 cluster、连续 macrophage/IFN/抗原呈递程序和重复边界。

• 复现 Zheng/10x PBMC 68k 单细胞数据：大规模免疫结构与连续程序

  2026年6月14日

  从 10x Genomics 公开 fresh PBMC 68k filtered matrix 出发，复核 QC、Leiden 结构、连续免疫程序、同矩阵 marker 一致性和单 donor 数据的统计边界。

• 复现 Tasic et al. 小鼠视觉皮层单细胞图谱：从 GSE71585 到兴奋性、抑制性和胶质细胞分类

  2026年6月13日

  基于 Tasic et al. 公开小鼠视觉皮层单细胞数据 GSE71585，复现 1,749 个作者 QC 通过细胞的 broad type、primary type、marker、signature score 和聚类对照，重点解释 glutamatergic、GABAergic、astrocyte、oligodendrocyte、OPC、microglia 和 endothelial 结构。

• 复现Paul et al.髓系祖细胞数据：连续谱系程序与小鼠级审计

  2026年6月12日

  基于Paul et al. GSE72857公开UMI表，复核8,751个祖细胞中的连续谱系程序、分开marker一致性和8只小鼠的程序中位数，撤回硬标签组成与细胞级总体推断。

• 复现 Darmanis et al. 人脑单细胞图谱：从 GSE67835 到神经元、胶质和血管细胞谱系

  2026年6月11日

  基于 Darmanis et al. 公开人脑单细胞数据 GSE67835，复现 466 个人脑细胞的表达图谱，重点检查 neurons、astrocytes、oligodendrocytes、OPC、microglia、endothelial 以及 fetal-like/replicating 类群的 marker 支撑和复现边界。