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Villani 血液 DC/monocyte 深度复现:FACS gate 与连续表达程序
基于 Villani et al. GSE94820 两个公开表达矩阵,比较 FACS gate 与 set 层面的连续程序、观察细胞数和同矩阵分离 marker 一致性,明确 donor 缺失时的解释边界。
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Tirosh 黑色素瘤深度复现:从 GSE72056 到恶性细胞程序、T 细胞耗竭和肿瘤微环境组成
基于 Tirosh et al. 黑色素瘤单细胞数据 GSE72056,进一步从作者 revised processed matrix 和注释出发,复核恶性/非恶性标签、肿瘤间组成、MITF/AXL-like 程序、T cell exhaustion 和公开矩阵层面的复现边界。
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复现Patel et al.胶质母细胞瘤单细胞异质性:患者结构与连续肿瘤程序
基于Patel et al.经典GBM数据GSE57872,复核430个原发肿瘤单细胞的患者结构和连续肿瘤程序;患者级汇总取代硬标签组成与细胞级总体推断。
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复现 Tasic et al. 小鼠视觉皮层单细胞图谱:从 GSE71585 到兴奋性、抑制性和胶质细胞分类
基于 Tasic et al. 公开小鼠视觉皮层单细胞数据 GSE71585,复现 1,749 个作者 QC 通过细胞的 broad type、primary type、marker、signature score 和聚类对照,重点解释 glutamatergic、GABAergic、astrocyte、oligodendrocyte、OPC、microglia 和 endothelial 结构。
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复现Paul et al.髓系祖细胞数据:连续谱系程序与小鼠级审计
基于Paul et al. GSE72857公开UMI表,复核8,751个祖细胞中的连续谱系程序、分开marker一致性和8只小鼠的程序中位数,撤回硬标签组成与细胞级总体推断。
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复现 Darmanis et al. 人脑单细胞图谱:从 GSE67835 到神经元、胶质和血管细胞谱系
基于 Darmanis et al. 公开人脑单细胞数据 GSE67835,复现 466 个人脑细胞的表达图谱,重点检查 neurons、astrocytes、oligodendrocytes、OPC、microglia、endothelial 以及 fetal-like/replicating 类群的 marker 支撑和复现边界。